河套大学生化系是在原巴彦淖尔盟教育学院生化系(1984年)的基础上于 2001 年成立的，现设有化学教育、生物教育、环境保护与监测、染整技术四个专业。学制三年。通过系统培养，使学生掌握扎实的基本知识、基本理论、实验方法和技能，并熟练地运用现代化教学手段，形成良好的专业素质 , 教师素养。生物教育、化学教育、环境保护与监测专业学生能够从事中、小学以及在厂矿企业药、食品加工、化工、种业等部门的技术工作。

    生化系师资队伍力量雄厚，结构合理，教学经验丰富，教研能力强，素质优良，现有教师 20 人，副教授 5 人，高级讲师 1 人，高级实验师 2 人，讲师 2 人，实验师 2 人。学科带头人 2 人，专业带头人１人，双师型教师 11 人，硕士 2 人，在读硕士 2 人。

    生化系实验、实训条件优越，共有实验室15个,占地面积1190平方米,实验楼设有植物学、动物学、植物生理、动物生理学、物化、化工、环保、有机、无机、分析、仪器分析、解剖、精密室等实验室，仪器设备值160 万元。拥有巴彦淖尔市环保局、巴彦淖尔市产品质量计量检测所、东大园艺等实训基地。

    生化系组织毕业生进行各类职业技能考试、专升本考试、后本考试。生化系毕业生近两年就业率达 92.5% ，分布在中、小学、职业技术学校、厂矿企业、药业、种业、食品加工业等部门，工作地点有北京、广州、呼市、自治区各盟市等全国各地，毕业生工作质量较好、信誉好。