土木工程系是河套学院十二个教学部系之一，现有普通专科在校生近1000人，在职教职工60人，其中博士1人，硕士22人，教授5名，副高14人，自治区教学名师一人、自治区教坛新秀一名。

土木工程系设置的专科专业有：建筑工程技术专业、道路桥梁工程技术专业、水利工程专业和工程造价，本科专业有农业水利工程专业。就读我系专科的学生都有专升本的机会。

长期以来土木工程系高度重视教学质量工程的建设，获得多项教学质量工程奖：其中：一项内蒙古自治区教学成果二等奖，一项自治区级教学团队；建筑工程技术专业和道路桥梁工程技术专业被评为自治区品牌专业。《建筑材料》、《工程力学》和《水利工程制图》被评为自治区级精品课程。另外有6门课程被评为河套学院校级精品课程。

土木工程系拥有实验设备先进的测绘实验室、材料力学实验室、建筑材料实验室、土工实验室、水力学实验室、灌溉排水实验室、水泵实验室、地质标本室及工程软件实训室。

近年来，土木工程系教师主持省部级科研项目10项、教研项目5项，先后在省部级以上刊物发表的论文有150多篇，主编、参编教材20多部。获得巴彦淖尔市自然科学奖两项。

多年来，土木工程系坚持以培养高素质应用型人才为目标，以就业为导向，积极推进产学研合作办学模式，重视实践能力的培养，在全区举办的“斯维尔杯”BIM系列软件建筑信息模型大赛”安装算量与清单计价取得了一等奖、设备设计三等奖，在自治区高校组织的历届测量大赛中，都取得了名列前茅的好成绩，由于我系的学生专业理论知识扎实、动手能力强，深受用人单位的好评，在国家加大水利工程投资和“一带一路”的大好形势下，就业率始终保持在90%以上。